Sensibilidad de Escherichia coli frente a fosfomicina, en infecciones urinarias provenientes de personas con discapacidad que acudieron a la Secretaría Nacional por los Derechos Humanos de las Personas con Discapacidad-SENADIS

Introducción: Fosfomicina es un antimicrobiano de amplio espectro utilizado para el tratamiento de las infecciones urinarias bajas; tiene actividad sobre bacilos gramnegativos y cocos grampositivos, así también sobre microorganismos multirresistentes, además de ofrecer una alternativa terapéutica de administración vía oral en dosis única, alcanzando una efectividad de 90%. Objetivo: Conocer la sensibilidad in vitro de Escherichia coli frente a fosfomicina, en infecciones urinarias provenientes de personas con discapacidad. Material y Método: Estudio observacional, descriptivo, prospectivo, en el que se incluyó un total de 273 muestras de urocultivo, de pacientes de ambos sexos que acudieron a SENADIS, y que en el momento de la consulta presentaban síntomas de infección del tracto urinario, por lo que se les solicitó el análisis de orina simple y cultivo. De las muestras procesadas en el laboratorio de microbiología, que fueron positivas con crecimiento bacteriano significativo, se procedió a la identificación bacteriana y a la realización del antibiograma según las recomendaciones de CLSI. Resultados: De estas 273 muestras, 91 fueron positivas para diferentes uropatógenos, 62/91 (68%) resultaron ser E. coli. De estas cepas de E. coli, 59/62 (95%) mostraron sensibilidad in vitro a fosfomicina. Comentario: Aunque el número de muestra obtenido es pequeño y no extrapolable ampliamente, pretendemos extender el trabajo por un tiempo más para compararlo más adelante. Conclusiones: Se observa que fosfomicina presenta buena actividad in vitro frente a cepas de E. coli aisladas de urocultivo, pudiendo representar una buena alternativa terapéutica a ser utilizada en la población en estudio.

Background: Fosfomycin is a broad-spectrum antibiotic used for the treatment of lower urinary tract infections, it is active against gramnegative bacilli and grampositive cocci, as well as against multi-resistant microorganism, in addition to offering a therapeutic alternative for oral administration in a single dose, reaching an effectiveness of 90%. Aim: To study the susceptibility of Escherichia coli to fosfomycin in urinary tract infections, of isolated strains obtained from patients with disabilities. Methods: It is an observational, descriptive, prospective study in which a total of 273 urine culture samples of patients of both sexes who attended the SENADIS were included, and who at the time of the consultation presented symptoms of urinary tract infection. The urine positive cultures with significant bacterial growth were performed to determine its bacterial identification and the antibiogram according to CLSI recommendations. Results: Of these 273 samples, 91 samples were positive for different uropathogens, with 62/91 (68%) being positive for E. coli. Of these E. coli strains, 59/62 (95%) showed in vitro susceptibility to fosfomycin. Comment: Although the number of samples obtained is small and it cannot be extrapolated, we pretend to extend the work for a while longer to be able to compare it later. Conclusion: Fosfomycin has good activity in vitro against E. coli isolated from urine culture in our institution, representing a good alternative to be used in our study population

Antibiotic susceptibility and fosfomycin resistance characterization in a cohort of children older than 6 years of age with urinary tract infection / Sensibilidad antibiótica y caracterización de la resistencia a fosfomicina en una cohorte de niños mayores de 6 años con infección urinaria

Fosfomycin tromethamol (FT) was reintroduced as an option for the treatment of low urinary tract infection (UTI) in children. In this study, we described the antibiotic sensitivity and mechanisms of resistance to fosfomycin in isolates from children older than 6 years with UTI. Urine culture and antibiotic susceptibility study were performed. In fosfomycin resistant strains, PCR for fos, blaCTX-M was performed followed by classification by phylogenetic group and sequencetyping. Escherichia coli was the most frequent etiological agent (89.2%). The susceptibility percentages were: fosfomycin 97.9%; amoxicillin-clavulanate 92.7%; cefuroxime and ceftriaxone 99%; nitrofurantoin 94.4%. An E. coli strain (ST69, phylogenetic group D) was resistant to fosfomycin (MIC 256mg/l) and carried the blaCTX-M-14 and fosA3 genes in a 45kb IncN-type plasmid.

La fosfomicina-trometamol (FT) se reintrodujo como una opción para el tratamiento de la infección del tracto urinario (ITU) baja en niños. En este estudio describimos la sensibilidad antibiótica y los mecanismos de resistencia a FT en aislamientos de niños mayores de 6 anos con ITU. Se realizaron urocultivos y estudios de sensibilidad antibiótica. En las cepas resistentes a fosfomicina se realizó la técnica de PCR para fos, blaCTX-M, y su identificación según su grupo filogenéticoy secuenciotipo. Escherichiacoli fue el agente etiológico más frecuente (89,2%). Los porcentajes de sensibilidad fueron: fosfomicina 97,9%; amoxicilina-clavulánico 92,7%; cefurox-ima y ceftriaxona 99%; nitrofurantoína 94,9%. Una cepa de E. coli (ST69, grupo filogenético D) fue resistente a fosfomicina (CIM 256mg/l) y portaba los genes blaCTX-M-14 y fosA3 en un plás-mido de 45 kb del tipo IncN. Este es el primer reporte de E. coli ST69 con blaCTX-M-14/fosA3 de origen humano.

Sensibilidad in vitro de Escherichia coli a la fosfomicina en urocultivos en un Servicio Asistencial Privado de Asunción / In vitro sensitivity of Escherichia coli to fosfomycin in urine cultures in a private healthcare service in Asunción

La fosfomicina es un antibiótico natural, que actúa sobre la síntesis de la pared celular, con actividad bactericida y de amplio espectro. En este trabajo se evaluó la sensibilidad in vitro de aislados de Escherichia coli (E. coli), incluidos aquellos que producen Beta Lactamasa de Espectro Extendido (BLEE) obtenidos a partir de urocultivos, tomados en diferentes lapsos de colección de datos, en personas de ambos sexos. Fueron incluidos 260 muestras de orina con desarrollo de E. coli provenientes de pacientes que concurrieron al Laboratorio San Roque. El aislamiento e identificación bacteriana se realizó según métodos convencionales y la sensibilidad a los antimicrobianos por el método de difusión de disco. Para la detección de la sensibilidad frente a fosfomicina fueron utilizados discos de 200 µg con el agregado de 50 µg de glucosa 6-fosfato. Se observó frente a los antibióticos evaluados mayor sensibilidad a fosfomicina (98,5%) y nitrofurantoína (97,7%). Ciprofloxacina, trimetoprima y la combinación sulfametoxazol/trimetoprima exhibieron frente a los mismos aislados sensibilidad menor y muy similar entre ellos, con 64,2%, 61,2% y 61,2% respectivamente. En 44 (16,9%) de los aislados de E. coli se detectó la presencia de BLEE y es destacable la alta sensibilidad que mostraron fosfomicina y nitrofurantoína, aún frente a los aislados BLEE positivos, con frecuencias de 90,9% y 93,2%, respectivamente. En resumen, la alta sensibilidad demostrada en el presente estudio por E. coli ante la fosfomicina, abre la posibilidad de considerar a este antibiótico de primera elección en las infecciones urinarias bajas, aún en los casos de gérmenes productores de BLEE, en la población de nuestro país.

Fosfomycin is a natural antibiotic, which acts on the synthesis of the cell wall, with broad spectrum bactericidal activity. In this study, the in vitro sensitivity of Escherichia coli (E. coli) isolates was evaluated, including those that produce Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL) obtained from urine cultures taken at different data collection times, in people of both sexes. Were included 260 urine samples with development of E. coli from patients who attended the San Roque laboratory. Bacterian isolation and identification was carried out according to conventional methods and antimicrobial sensitivity by the disk diffusion method. For detection of sensitivity to fosfomycin, 200 µg discs were used with the addition of 50 µg of glucose 6-phosphate. A greater sensitivity for fosfomycin (98.5%) and nitrofurantoin (97.7%) was observed against the evaluated antibiotics. Ciprofloxacin, trimethoprim and the sulfamethoxazole / trimethoprim combination exhibited in front of the same isolated lower sensitivity and very similar among them, with 64.2%, 61.2% and 61.2% respectively. In 44 (16.9%) of the E. coli isolates the presence of ESBL was detected and the high sensitivity shown by fosfomycin and nitrofurantoin is noteworthy, even compared to the positive ESBL isolates, with frequencies of 90.9% and 93,2%, respectively. In summary, the high sensitivity demonstrated in the present study by E. coli to fosfomycin opens the possibility of considering this first-choice antibiotic in lower urinary infections, even in ESBL-producing germs, in the population of our country.

Fosfomicina en el tratamiento de la infección urinaria baja en niños mayores de 6 años. Evolución clínico-microbiológica / Fosfomycin for low urinary-tract infections in children of over 6 years of age. Clínical-microbiological evolution / Fosfomicina no tratamento da infecção do trato urinário baixo em crianças maiores de 6 anos de idade. Evolução clínico-microbiológica

Resumen: Introducción: fosfomicina trometamol (FT) representa una alternativa al tratamiento de la infección del tracto urinario (ITU) baja. Uruguay no dispone de información acerca de su uso en niños. Objetivo: describir la evolución clínica y microbiológica de una cohorte de niños mayores de 6 años con ITU baja tratados con FT. Material y método: se incluyeron niños mayores de 6 años con ITU baja de dos prestadores de salud de Montevideo, entre 1/2/2018 - 30/6/2019. A todos se indicó FT 2 g monodosis y urocultivo de control. Se realizó seguimiento telefónico. Se evaluó: clínica, antecedentes de ITU, microorganismo, susceptibilidad antimicrobiana y evolución: tiempo de resolución clínica, resolución microbiológica, efectos adversos, recurrencia en los primeros tres meses. Resultados: se incluyeron 46 niños, mediana de edad 9,4 años, antecedentes de ITU 13. Presentaron disuria 44, tenesmo 33, polaquiuria 31. Microorganismo aislado: E. coli 43, S. saprophyticus 2, Proteus sp 1. Todos susceptibles a FT, excepto S. saprophyticus naturalmente resistente. Resolución clínica en 48 horas: 42. Se obtuvo urocultivo de control en 31/46 niños: resolución microbiológica 22, no resolución 5 y contaminado 4. Presentaron efectos adversos 9: vómitos 1, diarrea 8 y cefalea 1. Seguimiento telefónico a 40/46 pacientes: reinfecciones al mes de tratamiento: 6. Conclusiones: no se registró resistencia adquirida en los microorganismos. Se observó resolución clínica en las primeras 48 horas en la mayoría de los casos. Los efectos adversos fueron leves. Ocurrieron reinfecciones en una proporción pequeña. Los resultados avalan a FT como alternativa terapéutica para ITU baja en mayores de 6 años.

Summary: Introduction: fosfomycin tromethamine (FT) is an alternative to the treatment of low urinary tract infection (UTI). Uruguay does not have information about its use in children. Objective: to describe the clinical and microbiological evolution of a cohort of children older than 6 years of age with low UTI treated with FT. Materials and methods: we included children of over 6 years of age with low UTI from two health providers in Montevideo between 2/1/2018 and 6/30/2019. We prescribed a single dose of FT 2 g and a control urine culture to all patients. We carried out a telephone follow-up and assessed their clinical record, history of UTI, microorganisms, antimicrobial susceptibility and evolution: time of clinical resolution, microbiological resolution, adverse effects, and recurrence during the first 3 months. Results: 46 children were included, median age 9.4 years, history of UTI 13. 44 presented dysuria, 33 tenesmus, 31 pollakiuria. Isolated microorganism: E. coli 43, S. saprophyticus 2, Proteus sp 1. All susceptible to FT, except S. saprophyticus, naturally resistant. Clinical resolution in 48 hours: 42. Control urine culture was obtained in 31/46 children: microbiological resolution 22, no resolution 5 and contaminated 4. Adverse effects 9: vomiting 1, diarrhea 8, and headache 1. Telephone follow-up carried out for 40 / 46 patients: reinfections after one month of treatment: 6. Conclusions: microorganisms had not acquired resistance. Most cases showed clinical resolution during the first 48 hours. Adverse effects were mild. Reinfections occurred in a small proportion. The results support FT as a therapeutic alternative for low UTI for the case of children of over 6 years of age.

Resumo: Introdução: A fosfomicina trometamina (FT) é uma alternativa ao tratamento da infecção do trato urinário baixo (ITU). O Uruguai não possui informações sobre seu uso em crianças. Objetivo: Descrever a evolução clínica e microbiológica de uma coorte de crianças maiores de 6 anos de idade com ITU baixa tratada com TF. Materiais e métodos: Foram incluídas crianças maiores de 6 anos de com ITU baixa de dois provedores de saúde em Montevidéu; no período 1/2 / 2018 e 30/06/2019. Todos os pacientes receberam indicação de FT 2 g em dose única, cultura de urina e controle. Realizou-se um rastreamento por telefone. Se avaliou: prontuário clínico, história de ITU, microrganismos, suscetibilidade a antimicrobianos e evolução: tempo de resolução clínica, resolução microbiológica, efeitos adversos, recorrência nos primeiros 3 meses. Resultados: Incluíram-se 46 crianças, mediana de idade 9,4 anos, história de ITU 13. 44 delas apresentaram disúria, tenesmo 33, polaciúria 31. Microrgoanismo isolado: E. coli 43, S. saprophyticus 2, Proteus sp 1. Todas suscetíveis a FT, exceto S. saprophyticus, naturalmente resistente. Resolução clínica em 48 horas: 42. Obtivemos cultura de urina controle em 31/46 crianças: resolução microbiológica 22, sem resolução 5 e contaminada 4. 9 delas apresentaram efeitos adversos 9: vômito 1, diarreia 8 e dor de cabeça 1. Realizamos acompanhamento telefônico em 40 / 46 pacientes: reinfecções um mês após tratamento, 6. Conclusões: Os microrganismos não adquiriram resistência. Na maioria dos casos observou-se resolução clínica nas primeiras 48 horas. Os efeitos adversos foram leves. As reinfecções ocorreram em pequena proporção. Os resultados apoiam o TF como uma alternativa terapêutica para ITU baixa para casos de crianças maiores de 6 anos de idade.

First characterization of K. pneumoniae ST11 clinical isolates harboring blaKPC-3 in Latin America / Primera caracterización de aislamientos clínicos de K. pneumoniae ST11 portadoresde blaKPC-3en América Latina

Abstract Antimicrobial resistance due to carbapenemase production in Enterobacteriaceaeclinical isolates is a global threat. Klebsiella pneumoniae harboring the blaKPCgene is one ofthe major concerns in hospital settings in Latin America.The aim of this study was to characterize the antibiotic resistance mechanisms and to typifyfour carbapenem-resistant K. pneumoniae clinical isolates from the city of Manizales, Colombia.We identified blaKPC-3in all four isolates by polymerase chain reaction and subsequentsequencing. The plasmid-mediated quinolone resistance genes qnrB19-like and aac(6)Ib-cr;fosfomycin resistance gene fosA and an insertion sequence IS5-like in mgrB (colistin resistance)were also detected. Sequence types ST11 with capsular type wzi75, and ST258 with wzi154,were characterized. The blaKPC-3gene was mobilized in a 100-kb IncFIB conjugative plasmidwith vagCD toxin-antitoxin system.This work reports multiple resistance genes in blaKPC-producing K. pneumoniae and the firstoccurrence of ST11 clinical isolates harboring blaKPC-3in Latin America.

Resumen La resistencia a antibióticos mediada por la producción de carbapenemasas en aislamientos clínicos de Enterobacteriaceae es una amenaza mundial. Klebsiella pneumoniae portador de blaKPC es uno de los mayores problemas a nivel hospitalario en Latinoamérica. El objetivo de este estudio fue caracterizar los mecanismos de resistencia antibiótica y tipificar cuatro aislamientos clínicos de K. pneumoniae resistentes a carbapenems obtenidos en la ciudad de Manizales, Colombia. Se identificó blaKPC-3 en todos los aislamientos mediante reacción en cadena de polimerasa y secuenciación. También se detectaron los genes de resistencia transferible a quinolonas qnrB19-like y aac(6')Ib-cr y a fosfomicina fosA, y la secuencia de inserción /S5-like en mgrB (asociada a la resistencia a colistina). Se caracterizaron los secuenciotipos ST11 (cápsula wzi75) y ST258 (cápsula wzi154). Se comprobó que blaKPC-3 fue movilizado por un plásmido conjugativo IncFIB-vagCD de 100kb. En este trabajo se reportan múltiples genes de resistencia en K. pneumoniae productor de blaKPC y se describen por primera vez aislamientos clínicos ST11 productores de blaKPC-3 en Latinoamérica.

Evaluación de la eficacia de fosfomicina trometamol y gentamicina en la profilaxis de la cistoscopia flexible tras el estudio de los patógenos de nuestro entorno / Evaluation of the Efficacy of Fosfomycin Trometamol and Gentamicin in the Prophylaxis of Flexible Cystoscopy after the Study of Microflora in our Environment

Objetivo Optimizar el uso de antibióticos en la profilaxis de la cistoscopia flexible estudiando los patógenos más frecuentes de nuestro entorno y eligiendo el antibiótico según sus antibiogramas. Métodos Desde Enero del 2015 hasta Noviembre del 2015, se analizaron los urinocultivos de nuestra área, se eligió el antibiótico en función a su sensibilidad frente a los patógenos más frecuentes y se comparó con un antibiótico de amplio espectro. Desde Enero del 2016 hasta Diciembre del 2016, se realizaron las cistoscopias agrupando a los pacientes en: Grupo 1: Pacientes sin profilaxis; Grupo 2: Profilaxis con Gentamicina 240 mg; Grupo 3: Profilaxis con antibiótico seleccionado. Como variables principales se definieron la presencia de bacteriuria asintomática e ITU tras la realización de la cistoscopia flexible. Resultados Se analizaron 8.530 urinocultivos y se eligió la Fosfomicina Trometamol 3 gr como profilaxis. Se realizaron 244 cistoscopias distribuidas: Grupo 1: 86 (35%); Grupo 2: 72 (30%); Grupo 3: 86 (35%). Se detectó bacteriuria asintomática postcistoscopia en 6 pacientes (2,5%) en el Grupo 1, 7 pacientes (2,9%) en el grupo 2 y 5 pacientes (2%) en el grupo 3 no presentando diferencias significativas (p 0.120). Desarrollaron ITUs postcistoscopia 1 paciente (0,4%) en el Grupo 1, 5 pacientes (2%) en el Grupo 2 y 2 pacientes (0,8%) en el Grupo 3 sin diferencias significativas (p 0.105). Conclusión La Fosfomicina es tan efectiva como la Gentamicina en la profilaxis de la cistoscopia. Para un uso correcto de los antibióticos, se recomienda el estudio de los patógenos de nuestro entorno.

Objective To optimize the use of antibiotics in the prophylaxis of flexible cystoscopy by studying the most frequent pathogens in our environment and choosing the antibiotic according to its antibiograms. Method Between January 2015 and November 2015, urine cultures were analyzed in our area, the antibiotic was chosen based on its sensitivity to the most frequent pathogens and compared with a broad spectrum antibiotic. From January 2016 to December 2016, cystoscopy was performed by grouping patients into: Group 1 - Patients without prophylaxis, Group 2 - Prophylaxis with 240 mg gentamicin, Group 3 - Selected antibiotic prophylaxis. The main variables were the presence of asymptomatic bacteriuria and UTI after flexible cystoscopy. Results 8530 urine cultures were analyzed and 3 g of fosfomycin trometamol was chosen as the prophylactic. There were 244 cystoscopies: Group 1: 86 (35%); Group 2: 72 (30%); Group 3: 86 (35%). Asymptomatic bacteriuria was detected in 6 patients (2.5%) in Group 1, 7 patients (2.9%) in Group 2 and 5 patients (2%) in Group 3, showing no significant differences (p = 0.120). Post-cystoscopic urinary tract infection developed in 1 patient (0.4%) in Group 1, 5 patients (2%) in Group 2 and 2 patients (0.8%) in Group 3, which showed no significant differences (p 0.105). Conclusion Fosfomycin is as effective as Gentamicin as a prophylactic in cystoscopy. The study of the pathogens in each environment is recommended to correctly prescribe the antibiotic.

Sensibilidad a fosfomicina en Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido / Sensitivity to Fosfomycin in Extended-spectrum Betalactamase-producing Escherichia coli

RESUMEN Las infecciones urinarias son causadas mayormente por Escherichia coli (E. coli), el uso indiscriminado de antibióticos ha originado un aumento de infecciones por cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE). Con el objetivo de determinar la sensibilidad a fosfomicina se realizó un estudio en cepas de E. coli productoras de BLEE aisladas de urocultivos provenientes de un hospital de Perú. Se recolectaron 266 cepas de E. coli identificadas por métodos convencionales como productoras de BLEE. Se determinó la sensibilidad de fosfomicina por concentración inhibitoria mínima mediante el método de dilución en agar y por el método de disco difusión. Se encontró 192 (72,2 %) cepas de E. coli productora de BLEE sensibles a fosfomicina. Se concluye que la fosfomicina presenta actividad antimicrobiana frente a cepas de E. coli productoras de BLEE, y podría ser considerada una buena opción terapéutica frente a cepas resistentes.

ABSTRACT Urinary infections are caused mainly by Escherichia coli (E. coli); indiscriminate use of antibiotics has caused an increase in infections due to extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing strains. Aiming to determine the sensitivity to fosfomycin, a study was conducted in ESBL-producing E. coli strains isolated from urine cultures at a hospital in Peru. Two hundred and sixty-six (266) strains of E. coli were collected, which were determined by conventional methods to be ESBL- producing. Sensitivity to fosfomycin was determined through minimum inhibitory concentration with the agar dilution method and the diffusion disc method. One hundred and ninety-two (192) (72.2%) strains of ESBL-producing E. coli strains sensitive to Fosfomycin were found. It, therefore, follows that fosfomycin exhibits antimicrobial activity against ESBL-producing E. coli strains and that it could be considered a good treatment option for resistant strains.